Расплачиваясь за долг, Гомер пускает Жирного Тони снимать в своей гостиной сомнительный фильм. Разъярённая Мардж уезжает и встречает морского биолога Калеба Торна, который посвятил себя спасению ламантинов. Добившись переноса музея марок, Симпсоны получают под окнами старое кладбище, и перепуганная Лиза перебирается спать к родителям. В дом приносят письмо, написанное много лет назад, и Гомер одержимо ищет родного отца, а дед попадает в богадельню.
Увидев у Ленни плазменный телевизор, Гомер загорается купить такой же и вместе с Мардж идёт на телешоу с обменом жёнами. В Италии, куда семья едет за новой спортивной машиной для Бёрнса, Симпсоны сталкиваются с Сайдшоу Бобом и его кровожадной роднёй. Скиннера увольняют, новая директриса делит школу на мальчиков и девочек, и Лиза ради настоящей математики переодевается мальчиком. Выставка об эволюции в Музее естественной истории вызывает скандал на весь город, и за свои научные взгляды девочка расплачивается свободой.
Проиграв пари на футбол, Гомер рассчитывается с Жирным Тони разрешением снимать в гостиной фильм для взрослых. Застав съёмки, разъярённая Мардж оставляет его с детьми и уезжает на пляж. Встретившийся ей морской биолог Калеб Торн спасает ламантинов и заодно пытается спасти Мардж от мужа, который её не ценит.
Симпсоны добиваются, чтобы музей марок построили подальше от их дома, на месте старого кладбища, однако само кладбище в итоге переезжает к ним по соседству. Ночной вид на могилы так пугает Лизу, что она перебирается спать к родителям. Гомер и Мардж пытаются доказать дочери, что бояться нечего, сами не справляются со страхом и идут к психиатру. Сама девочка решает встретиться с ужасом лицом к лицу и ночью одна отправляется на кладбище.
Мэгги заболевает ветрянкой, и Гомер устраивает платную вечеринку для родителей, желающих заразить своих детей. Праздник становится тяжёлым испытанием для брака хозяев и для родителей Милхауса. Сам мальчик вскоре понимает, что раньше, когда они боролись за его любовь, ему жилось лучше, и затевает тайную операцию.
В первой хеллоуинской страшилке Барт впадает в кому, и родители берут на его место мальчика-робота Дэвида. Гомера с друзьями затем приглашает на охоту в своё поместье мистер Бёрнс, причём дичью там назначены сами гости. На конкурсе костюмов из третьей настоящая ведьма превращает горожан в тех, кем они нарядились, и снять заклятие может лишь Мэгги в ведьмином наряде.
Заметив, что Мардж одиноко, Барт старается чаще бывать рядом с матерью. Поездки на двухместном велосипеде и чайная в домике на дереве приносят ему в школе прозвище маменькиного сынка. Узнав о насмешках, Мардж берётся помочь сыну вернуть репутацию. Гомер тем временем вместе с Мо выступает на профессиональных турнирах по армрестлингу.
На День отца Гомер восторгается подарком Барта и равнодушно принимает книгу от Лизы, из-за чего дочь от него отдаляется. Кража дорожного знака Бартом заканчивается большой аварией, и мэр Куимби придумывает для города талисман, Саламандру безопасности. Ради примирения с Лизой Гомер надевает этот костюм и прославляется в нём. Город тем временем требует переизбрать мэра, и новый герой сам выдвигает свою кандидатуру.
Из-за драки Гомера с Пасхальным кроликом на празднике у мэра от Мардж отворачивается весь город. Оставшись одна, она вступает в женский клуб «Весёлые помидорины» и соглашается помочь в благотворительной акции, которой оказывается кража яиц Фаберже у мистера Бёрнса. Лиза мечтает провести лето в Италии и ради языка нанимает учителя по объявлению, а им оказывается Милхаус.
Разбив старую машину, мистер Бёрнс посылает Гомера в Италию за новым спорткаром, и тот берёт с собой всю семью. По дороге Симпсоны застревают в маленькой деревне, где мэром служит исправившийся Сайдшоу Боб. Гости решают молчать о его прошлом, пока один из них не выбалтывает секрет за вином.
Когда машина преподобного Лавджоя ломается по дороге на праздничную службу, Гомер вместо него излагает в церкви свою версию рождения Христа. Дедушка вспоминает, как на Второй мировой застрял на острове со стрелком Бёрнсом и по ошибке сбил Санта-Клауса вместо вражеского самолёта. Последняя из трёх рождественских частей поставлена под музыку балета «Щелкунчик», на которую горожане готовятся к празднику.
Ярость Мардж из-за новых платных дорог приводит к находке замёрзшего почтальона с письмами сорокалетней давности. Из письма, адресованного покойной матери Гомера, следует, что его настоящий отец вовсе не дедушка. Гомер разыскивает богатого Мейсона Фэрбенкса, с радостью сближается с ним и отворачивается от старика, который растил его 40 лет.
Барт крадёт ключ из кабинета директора Скиннера, и родители решают отправить его в исправительный лагерь. Везти сына выпадает Гомеру, которому приходится отменить долгожданную поездку в Лас-Вегас с друзьями. По дороге отец старается сблизиться с мальчиком, а Мардж дома тем временем распродаёт их старые вещи.
Новый учитель физкультуры мистер Крапт устраивает детям безжалостную игру в вышибалы. Месть Барта оборачивается разрушением лачуги садовника Вилли, и Симпсоны берут пострадавшего к себе. Поспорив с братом, Лиза делает Вилли темой школьного научного проекта и берётся воспитать из него настоящего джентльмена. Гомер рвёт последние любимые синие брюки и затевает рекламную кампанию, чтобы вернуть их в продажу.
В пещерах папы Карла Гомер тянется за кусочком сталактита, пол проваливается, и сам он застревает вниз головой в потолке нижнего зала. Мардж, Барт и Мэгги уходят за помощью, а Лиза остаётся с отцом и коротает время рассказом. Из него быстро вырастает целая цепочка вложенных выдумок, где есть упрямый баран, особняк мистера Бёрнса и сокровище из таверны Мо.
Выигранный на церковной ярмарке компьютер Фландерсу не нужен, и он дарит его Мардж. Та в ответ присматривает за Родом и Тоддом, пока сосед ездит на съезд левшей, и учит мальчиков быть обычными мальчишками. Гомер тем временем везёт Барта и Лизу в приют для животных-знаменитостей, где обезьяна Тут-Тут затаскивает Барта в свою клетку. О похищении сына мать узнаёт из экстренного выпуска новостей.
Плазменный телевизор Ленни так поражает Гомера, что он три дня не уходит из квартиры друга. Выигранная поездка на киностудию приводит его к телешоу с обменом жёнами, где можно заработать на собственный экран. Вопреки желанию Мардж семья участвует в съёмках, и к Гомеру приезжает властная Верити. Сама Мардж поселяется у забитого Чарли, который быстро в неё влюбляется.
Гомер добивается, чтобы в Спрингфилде появилась профессиональная футбольная команда. Комиссар лиги по пути к официальному решению заезжает к Симпсонам, где дедушка Эйб принимает его за грабителя и нападает на него. Город лишается команды, а самого Эйба начинают ненавидеть все соседи. Пережив отчаяние, старик решает жить без страха.
Мистер Бёрнс закрывает станцию, переводит работу в Индию и посылает туда единственного оставшегося члена профсоюза Гомера обучать новых сотрудников. Успехи приносят ему полную власть над станцией, и он объявляет себя богом. Сельма и Пэтти в это время везут Барта и Лизу на съезд поклонников Макгайвера и похищают актёра, сыгравшего любимого героя. Пленнику такая жизнь неожиданно нравится, и уезжать он отказывается.
Семейный ужин в ресторане «Жареный голландец» не задаётся, и Симпсоны спасают вечер рассказами о морских бедствиях. Лиза вспоминает плавание «Мэйфлауэра», где Мардж с детьми плывут пилигримами, а к ним прибивается плут Гомер. Рассказ Барта посвящён мятежу на «Баунти», причём капитаном Блаем становится директор Скиннер, а сам Барт бунтует в роли мистера Кристиана. Гомер описывает первый рейс лайнера семидесятых, который не мог перевернуться, однако перевернулся.
После мюзикла о Щекотке и Царапке директор Скиннер позволяет себе сексистское замечание о женщинах, и попытки оправдаться заканчиваются его увольнением. Новая директриса Мелани Апфут делит школу на две половины, для мальчиков и для девочек. Математика на девичьей половине кажется Лизе пустой, а заниматься на мальчишеской ей запрещают. Тогда под именем Джейка Боймана она переодевается и с помощью Барта учится вести себя как мальчик.
Перед приходом выигранной в конкурсе домработницы Мардж в уборочном порыве смешивает едкие средства и теряет сознание. Очнувшись, она ничего не помнит. Воспоминания о детях постепенно возвращаются, а Гомер остаётся для неё чужим. Пока Сельма и Пэтти снова водят сестру на свидания, муж пытается завоевать её заново.
Лиза ведёт семью в Музей естественной истории, где выставка об эволюции возмущает Фландерса. По настоянию преподобного Лавджоя школа берётся за креационизм, а городское собрание голосует за преподавание одной этой теории. Девочка в одиночку защищает науку и даёт тайные уроки эволюции, которые приводят её на скамью подсудимых.
Бейсболист Бак Митчелл играет всё хуже, потому что его жена, певица Табита, вызывающе ведёт себя на публике. Заметив на стадионном экране страстный поцелуй Гомера и Мардж, он просит у них совета по семейной жизни. Дела у команды идут на поправку, пока Бак не застаёт Гомера за массажем шеи Табиты. После этого обе пары расходятся.